1924年11月6日，陈灏珠出生于香港。1941年底，香港沦陷于日军之手，陈灏珠一家在香港生活难以为继，被迫返乡。陈灏珠在香港的少年经历，以及父亲对他学业和个性产生的影响，为陈灏珠后来成长为医学大家打下了基础。