在小镇事件尘埃落定后不久，林浩和艾莉森接到了一通紧急电话，来自一位名叫哈罗德·温特的大学教授的女儿。她声称自己的父亲在一周前神秘失踪，最后一次被人看见是在他的研究室里。警方初步调查后并未发现任何可疑迹象，但她坚信父亲的失踪与他正在进行的一项秘密研究有关。
林浩和艾莉森立即前往教授的住所和研究室进行调查。在研究室的最深处，他们发现了一本被锁住的笔记本。经过一番努力，他们成功打开了笔记本，里面记录着教授关于记忆恢复技术的实验细节，以及他对自己记忆进行修改的尝试。
深入调查后，林浩和艾莉森了解到，教授一直在研究一种能够修改和恢复记忆的技术。这项技术最初是为了帮助那些患有阿尔茨海默病的患者，但随着时间的推移，教授开始对这项技术的极限产生了好奇，甚至在自己身上进行了实验。
林浩和艾莉森意识到，教授的失踪可能与他的实验有关。他们开始追踪教授的最后行踪，询问了他的同事和学生，试图还原他失踪前的最后时刻。在一次偶然的机会下，他们发现教授曾在失踪前联系过一位神经科学家，留下了关于他实验的线索。
通过那位神经科学家提供的信息，林浩和艾莉森得知教授的实验可能在他私人实验室的一个隐秘区域进行。他们潜入实验室，发现了一个高度保密的地下设施，里面装满了复杂的机器和实验记录。
在地下实验室的深处，林浩和艾莉森终于找到了教授。但令他们震惊的是，教授似乎失去了所有的记忆，包括自己的身份。通过实验室中的记录，他们发现教授在实验中遭遇了意外，导致他的记忆被彻底抹除。
林浩和艾莉森决定帮助教授恢复记忆。他们利用教授的实验记录和智慧之城的技术，尝试逆向工程，逐步恢复了教授的部分记忆。在这个过程中，他们也对记忆的本质和人类的意识有了更深刻的理解。