第14章 生化要点

生酮氨基酸,亮氨酸和赖氨酸。生酮兼生糖氨基酸,异亮氨酸,苯丙氨酸,酪氨酸,色氨酸,苏氨酸。

非极性脂肪族氨基酸,亮氨酸,异亮氨酸,甲氨酸,丙氨酸,甘氨酸,甲硫氨酸,脯氨酸。

半胱氨酸和甲硫氨酸含有硫元素,丝氨酸和苏氨酸含有两个羟基。

有共轭双键的色氨酸和酪氨酸最大吸收峰在280纳米波长。

极性中性氨基酸,天冬酰胺,丝氨酸,半胱氨酸,谷氨酰胺,苏氨酸。

支链氨基酸有三个,缬氨酸,亮氨酸,异亮氨酸。

含芳香环的氨基酸有三个,苯丙氨酸,酪氨酸(极性),色氨酸。

含有两个氨基的氨基酸有很多,常见的如赖氨酸(Lys)其侧链上含有一个氨基,共有两个氨基。此外,精氨酸、组氨酸等也可看作含有两个氨基相关结构特征的氨基酸。精氨酸含有胍基,在一定意义上也可视为具有额外的类似氨基的碱性基团;组氨酸的咪唑基也具有一定碱性。

酸性氨基酸,天冬氨酸,谷氨酸,其有两个羧基,另一个在支链上,碱性氨基酸,精氨酸,组氨酸,赖氨酸。酸性氨基酸等电点偏低,碱性氨基酸等电点偏高。

蛋白质一级结构氨基酸的排列顺序决定了二三四级结构,一结构主要由肽键二硫键稳定构象,二级结构阿尔法螺旋和贝塔折叠为主的四种有氢键稳定结构,超二级结构为亚基,三级结构主要有氢键盐键疏水作用和泛德华力,一般认为疏水作用最主要,结构域属于模体,介于三四级之间,四级结构主要是氢键和离子键。

蛋白质的的α-螺旋中,螺旋的走向是从N端(氨基端)到C端(羧基端)的右手螺旋,氨基酸侧链伸向螺旋外侧,主要靠氢键维稳。每3.6个氨基酸残基螺旋上升一圈,螺距为0.54nm。从整体看,螺旋是从肽链的N端向C端延伸。

脯氨酸经常在贝塔转角四个氨基酸中的第二位。

疏水集团在分子内部,亲水集团在分子表面,形成结构紧密的是三级结构的共同特点。

别构剂通过改变蛋白质的空间构象,从而导致蛋白质生物学活性随之变化。

一般的DNA,为B型DNA,双螺旋结构反向平行。两条链中一条链方向是5到3自上而下,另一条是5到3自下而上,均为右手螺旋,直径为2.37纳米,螺距为3.54纳米。每个螺旋有10.5个碱基对,碱基对平面之间垂直距离为0.34纳米。A-T两条氢键,G-C三条氢键。碱基疏水性,骨架亲水性,横向氢键维持稳定,纵向碱基堆积力维持稳定,碱基堆积力为疏水作用力。

其他两种DNA为A型和Z型,A型DNA是当环境湿度降低后DNA仍保持稳定,右手螺旋结构,但是空间结构参数改变,由10.5变成11。Z型DNA为左手螺旋结构,每螺旋碱基数为12。

染色体和染色质是同种物质的不同形态,染色体较致密,基本单位是核小体,核小体由DNA双链及组蛋白八聚体构成。

hnRNA经snRNA剪切变成mRNA。mRNA的结构包括三个,5末端区甲基鸟嘌呤核苷,又称5帽子结构,开放阅读框,3末端多聚腺苷酸,又称3多聚A尾。

tRNA二级结构是三叶草结构,三环一臂结构,5端连接双氢尿嘧啶环,又称DHU环,DHU→连接反密码子环,连接T屮C环,连接氨基酸臂,连接3端,这些结构域由氢键和碱基堆积力等作用力相互作用,最后形成了稳定的倒L型,为tRNA的三级结构。

还有一些特殊的RNA分子,比如,SnoRNA功能是对rRNA进行加工,SiRNA可降解外源性入侵的mRNA。

核酸嘧啶和嘌呤是含有共轭双键的分子,最大吸光260纳米附近,可以测试含量。280是蛋白质的吸光度,用A260和A280的比值可以鉴定纯度。

维生素是指机体维持正常功能所必需的。但在体内不能合成或合成量很少,必须由食物供给的一种低分子量有机物质。

遗传密码:从mRNA分子的五端AUG开始,每相邻的三个核苷酸为一组,代表某种氨基酸或其他信息。