二、《道藏》医药文献
《道藏》三洞四辅七部的医药文献芜杂多样，洞真、洞玄、洞神、太玄、太清、太平、正一每部分之情况也不尽相同，以下按照三洞四辅之顺序分别介绍其所包含医药文献之具体情况，其中太清部未整理出相关文献，则不予讨论。
1.洞真部医药文献
洞真部十二类文献典籍共收录文献327种，其分布情况如下:本文类78种，神符类8种，玉诀类60种，灵图类17种，谱录类13种，戒律类12种，威仪类30种，方法类62种，众术类20种，记传类19种，赞颂类6种，表奏类2种。洞真部医药文献大多分布在方法类、记传类、众术类和玉诀类；本文类、灵图类和谱录类亦有少量的涉医药类文献。威仪类、戒律类、神符类、赞颂类、表奏类皆没有关于医药的记述。现将洞真部涉医药文献的典籍名称陈列如下:
众术类非医药著作中含医药文献的典籍有《修真精义杂论》《抱一子三峰老人丹诀》《太上登真三矫灵应经》，方法类有《修丹妙用至理论》《修真十书》《太微灵书紫文琅玕华丹神真上经》《灵宝无量度人上经大法》《还丹众仙论》《西山群仙会真记》，本文类有《太上一乘海空智藏经》，谱录类有《梓潼帝君化书》和《洞玄灵宝真灵位业图》。
2.洞玄部医药文献
洞玄部共收道书300种。其中本文类70种，神符类8种，玉诀类33种，灵图类13种，谱录类12种，戒律类11种，威仪类80种，方法类23种，众术类20种，记传类17种，赞颂类8种，表奏类5种。本部分非医药著作中的医药文献分布较为分散，具体如下:
洞玄部本文类非医药著作中含医药文献的典籍有《洞玄灵宝丹水飞术运度小劫妙经》，神符类有《太上洞玄灵宝五符序》及《太上洞玄灵宝素灵真符》，玉诀类有《灵宝众真丹诀》《神仙服饵丹石行药法》，灵图类有《黄庭内景五脏六腑补泻图》，戒律类有《要修科仪戒律钞》，威仪类有《灵宝领教济度金书》，方法类有《灵宝玉鉴》《上清天枢院回车毕道正法》《高上月宫太阴元君孝道仙王灵宝净明黄素书》《太上灵宝净明院真师密诰》《上清天心正法》，众术类的见于《灵剑子》《黄帝太一八门逆顺生死诀》《玄圃山灵秘箓》等卷中，记传类的见于《仙苑编珠》及《仙都志》。
3.洞神部医药文献
洞神部十二类文献典籍共计364种:本文类51，神符类5，玉诀类88，谱录类15，戒律类7，威仪类26，记传类19，赞颂类7，表奏类3，灵图类6，方法类63，众术类74。在这些庞杂的文献之中，医药养生文献基本分布在灵图类、方法类及众术类三部分中。这些文献资料情况相对复杂，其中有些是医药著作，如《图经衍义本草》《石药尔雅》，而有些非医典籍中也涵盖多种药方及药物文献，但内容较分散，不具有系统性。
以下列出灵图、方法和众术类非医典籍中含医药文献的著作名称:灵图类的《四气摄生图》中包含医药文献；方法类有《太清中黄真经》《太清调气经》《嵩山太无先生气经》《幻真先生服内元气诀》《服气精义论》《神仙食气金柜妙录》《枕中记》《三洞枢机杂说》《神仙服食灵草菖蒲丸方传》《上清经真丹秘诀》《太清经断谷法》《太上肘后玉经方》《混俗颐生录》《保生要录》《修真秘箓》《三元延寿参赞书》《太清金阙玉华仙书八极神章三皇内秘文》《太上除三尸九虫保生经》《上玄高真延寿赤书》《紫团丹经》；众术类包含医药文献的典籍有《太清金液神丹经》《太清石壁记》《太清金液神气经》《太清经天师口诀》《太清修丹秘诀》《黄帝九鼎神丹经诀》《太极真人九转还丹经要诀》《玉洞大神丹砂真要诀》《上清九真中经内诀》《金华玉液大丹》《悬解录》《灵飞散传信录》《上洞心丹经诀》《灵飞散传信录》《通玄秘术》《神仙养生秘术》。
4.太玄部医药文献
据《道教义枢》和《云笈七签》记载，洞真经之辅为太玄；洞玄经之辅为太平；洞神经之辅为太清；通贯三洞和三太(即太清、太玄、太平)为正一部，它遍陈三乘，为以上六部之补充。太玄部共收录文献典籍113种。经梳理，太玄部载有药方的典籍主要有四种，分别为《黄帝内经素问遗篇》《太玄宝典》《云笈七签》和《至言总》。《云笈七签》载录药方数量占总量的绝大多数，其他三种载录的药方数量较少。太玄部收录的药方大部分包含组成、主治功用、制法、用法服法、注意事项、加减等相关论述。
太玄部中关于药物的典籍共10种，涉及的药物约390种。这10种分别是《爰清子至命篇》《长生指要篇》《道枢》《海客论》《还真集》《黄帝内经素问遗篇》《上阳子金丹大要图》《太玄宝典》《云笈七签》和《至言总》。在这些文献中，记载药物数量最多的是《云笈七签》，其次为《海客论》和《太玄宝典》。记载药物较少的是《爰清子至命篇》《长生指要篇》《道枢》《还真集》《黄帝内经素问遗篇》和《上阳子金丹大要图》。《云笈七签》为北宋张君房“掇云笈七部之英”汇集而成，共一百二十二卷，有关药物的记载主要集中在方药(卷七十四至卷七十八)，金丹(卷六十六至卷六十九、卷七十一)，金丹诀(卷六十三至卷六十五)和内丹(卷七十、卷七十二、卷七十三)。
5.太平部医药文献
《道藏》四辅部中除对药物的零散记载外，还收录了《仙传外科集验方》(又名《仙传外科秘方》)《葛仙翁肘后备急方》《孙真人备急千金要方》《急救仙方》和《孙真人备急千金要方目录》等医学著作。其中《急救仙方》《仙传外科集验方》《孙真人备急千金要方》和《孙真人备急千金要方目录》为太平部所收，鉴于此四部著作的理论研究和临床利用颇为广泛，故暂不涉及。据统计，太平部共收录166种典籍，其中载有医药文献的有26种。分别是:《急救仙方》《仙传外科集验方》《孙真人备急千金要方》《孙真人备急千金要方目录》《葆光集》《磻溪集》《草堂集》《丹阳神光灿》《道典论》《洞玄灵宝道学科仪》《渐悟集》《马自然金丹口诀》《三洞珠囊》《上方灵宝无极至道开化真经》《水云集》《太古集》《太极左仙公说神符经》《太上灵宝净明中黄八柱经》《无上秘要》《仙乐集》《云光集》《云山集》《重阳真人金关玉锁诀》《重阳全真集》《重阳真人授丹阳二十四诀》《上方灵宝无极至道开化真经》。
6.正一部医药文献
正一部共收录238种典籍，非医药典籍中涉及医药文献的有41种，分别是《北帝七元紫庭延生秘诀》《长生胎元神用经》《冲虚通妙侍宸王先生家话》《传授三洞经戒法箓略说》《丹阳真人直言》《道法会元》《道法心传》《洞玄灵宝道士明镜法》《洞玄灵宝五感文》《洞真金房度命绿字回年三华宝曜内真上经》《洞真三天秘讳》《洞真上清神州七转七变舞天经》《洞真太上说智慧消魔真经》《洞真太上紫度炎光神元变经》《海琼传道集》《海琼问道集》《离峰老人集》《龙虎精微论》《群仙要语纂集》《三洞道士居山修炼科》《三洞群仙录》《三十代天师虚靖真君语录》《上清道宝经》《上清洞天三五金刚玄箓仪经》《上清黄庭养神经》《上清灵宝大法》《上清明鉴要经》《上清太极真人神仙经》《上清太极真人撰所施行秘要经》《上清太上帝君九真中经》《上清仙府琼林经》《太平御览》《太清道林摄生论》《太上灵宝芝草品》《太上三五正一盟威箓》《太上助国救民总真秘要》《五岳真形图序论》《岘泉集》《玄真灵应宝签》《正一法文法箓部仪》《诸真内丹集要》。记载药物或药方较多的典籍有《洞真太上紫度炎光神元变经》《三洞群仙录》《三十代天师虚靖真君语录》《上清道宝经》《太上灵宝芝草品》《上清太上帝君九真中经》《上清明鉴要经》。
7.《续道藏》医药文献
明正统年间编成的《正统道藏》因有所缺漏，加之编成后又有道书相继问世，故至万历三十五年，明神宗命第五十代天师张国祥刊《续道藏》，是对《正统道藏》的补缺。根据《道藏提要》，《续道藏》收录的书籍与篇章共计58种，主要是有关经文、科仪等内容，如《太上中道妙法莲华经》《太上元始天尊说宝月光皇后圣母孔雀明王经》《先天斗母奏告玄科》等；还收录了《庄子翼》《老子翼》《古易考原》等书，但其中所涉及的医药文献篇幅较少。内容涉及医药的典籍有《化书》《上清元始变化宝真上经》和《消摇墟经》，而含医方的典籍仅《消摇墟经》一部，本书关于“太山老父”论述中提到“神枕”，该方在前面几部也出现过，唯名称不同。