数百年来，如何平衡肛瘘的治疗与维持肛门功能之间的关系一直困扰着肛肠专科医生。任何牵涉到肛管的外科手术都有可能损伤肛门括约肌而导致不同程度的肛门失禁。肛瘘手术的目的是在最低限度地减少括约肌损害的同时最大限度地消除症状。瘘管切开术适合于低位经括约肌肛瘘或括约肌间肛瘘；高位经括约肌间肛瘘、括约肌上方瘘或括约肌外侧瘘可以采用挂线引流、推移黏膜瓣/皮瓣技术、肛瘘栓，以及经括约肌间瘘管结扎术治疗。

中医学挂线疗法历史悠久，明代《古今医统大全》（1556）即曾经记载：“上用草探一孔，引线系肠外，坠铅锤悬，取速效。药线日下，肠肌随长，僻处既补，水逐线流，未穿疮孔，鹅管内消。”古代挂线疗法是依靠重力将药线持续不断地收紧，以线代刀将瘘道缓缓切开，同时切断组织也随之生长，药线并起引流作用，从而治愈肛瘘。挂线疗法发展到今天，其技术和治疗结果已发生根本变化。应用挂线疗法治疗复杂性肛瘘，系根据肛门直肠部解剖生理学特点，较好解决高位肛瘘完全切开所致肛门失禁的问题。

经括约肌间瘘管结扎术（LIFT）是一种安全有效的保留括约肌治疗经括约肌肛瘘的方法，能够有效维护肛门括约肌自控功能。最常见的手术失败原因是括约肌间切口感染/裂开，早期切开或单纯换药是有效处理方法。应用双氧水分步测试确定内口和瘘管是十分重要的步骤，可以有效避免错误的或不充分的瘘管结扎。